Από τη σεζόν 2007-08 έχει μπει η δεύτερη φάση του πρωταθλήματος στη ζωή μας. Ο Απόλλωνας τερματίζει για 4η φορά συνολικά στο πρώτο γκρουπ και τρίτη συνεχόμενη.
Και στις τέσσερις πρεμιέρες των αγώνων κατάταξης, η ομάδα της Λεμεσού απέτυχε να κερδίσει.
Η πρώτη φορά ήταν τη σεζόν 2009-10. Ο Απόλλωνας τερμάτισε στην 3η θέση στην κανονική διάρκεια, όντας στο -5 από την πρωτοπόρο Ομόνοια.
Στην πρεμιέρα έχασε με 2-0 από την Ανόρθωση στη Λάρνακα και οπισθοχώρησε σημαντικά.
Τη σεζόν 2013-14, ο Απόλλωνας τερματίζει στη 2η θέση συγκατοικώντας με το ΑΠΟΕΛ μετά το πέρας των 26 αγωνιστικών και έχει τρεις βαθμούς λιγότερους από την πρωτοπόρο ΑΕΛ.
Άσφαιρη πρεμιέρα, 0-0 με αντίπαλο την Ομόνοια και χάνει σημαντικό έδαφος.
Πέρσι, ο Απόλλωνας τερμάτισε πρωτοπόρος στην κανονική φάση του πρωταθλήματος και ήταν στο +3 από το ΑΠΟΕΛ που ακολουθούσε.
Πρεμιέρα με ήττα από τον Ερμή (1-0) στο «Αμμόχωστος». Ήταν «η αρχή του τέλους» για να χαθεί ο τίτλος.
Στη σεζόν που διανύουμε, ο Απόλλωνας για πρώτη φορά τερματίζει στο πρώτο γκρουπ και δεν ελπίζει στην κατάκτηση του τίτλου. Στην 5η θέση και στο -13 και -12 από τις δύο πρώτες θέσεις.
Πρεμιέρα με αντίπαλο την ΑΕΚ στο ΓΣΖ και αυτή τη φορά άπαντες στον Απόλλωνας ελπίζουν ότι θα κάνουν ποδαρικό με το… δεξί.